ماسبب ظهورطفرات جديدة بفيروس كورونا وهل هذه الطفرات فعلا هي اكثر خطر واشد ضراوه؟؟

د. عروه محمدهاني الملي 

الحقيقة ان موضوع الطفرات ليس خاص بهذه العائلة بل ان كل الفيروسات تتعرض لطفرات و لكن تعتبر الفيروسات التى تحوي على RNA وحيد السلسلة هي اكثر انواع الفيروسات الطافرة بما في ذلك كو*ر*و*نا والانفلونزا وذلك لعدة اسباب اهمها:
. تتميز هذه الفيروسات بسرعة تكاثرها بالخليه وباعداد كبيرة جدا لان مكوناتها بسيطة وسهلة التصنيع فكل خلية من الخلايا البشرية تنتج اكثر من مئة فيروس قبل انتحارها. هذه السرعة والكثافة والنسخ لتشكيل سلاسل جديدة من RNA تجعل نسبة الاخطاء اكبر بكثير.
. الفيروسات التي تحوي RNA لاتملك انظمة مراقبة وورشات اصلاح للخلل الذي يحدث (كمافي حالة DNA) .
. ان اكثر انواع الطفرات واسهلها حدوثا هي طفرة الحذف deletion. تحدث هذه الطفرات اثناء تشكيل السلسة الجديدة للفيروس حيث يتم نسيان وضع بعض القطع في السلسلة الجديدة. فتتشكل فيروسات غير طبيعية ناقصة بعض القطع الجينية مايسبب حدوث تغيرات من بعض خصائص الفيروس وهذه ما يحدث غالبا مع كور-رونا.
غالبا هذه الطفرات لاتسبب تغيير في عدوانية الفيروس ولكن هذا ليس قاعدة. فعند السنوريات مثلا عند حدوث طفرة حذف في سلسلة فيروس كو*ر*و*نا المعوي E cov قليل الضراوة يتحول الى فيروس شرس يصيب كل اجهزة الحسم وقاتل حتمي لا خلاص منه.
اذا الطفرات في فيروسات RNA هي شئ وارد بل متكرر جدا ولايعني تغير في ضراوة الفيروس دائما.
كل الطفرات الموجودة( مثل البريطانية و الجنوب أفريقية) حتى الآن لم تغير في ضراوة الفيروس بل غيرت من قدرته على العدوى وسرعة انتشاره . اذا ما سبب الاصابات والوفيات الكثيرة ؟السبب ان سرعة الانتشار أدت إلى زيادة عدد الاصابات وبالتالي ارتفاع اعداد الاصابات الشديدة والوفيات . اي رياضيا نسبة الوفيات لم تتغير ولكن عدد الوفيات هو الذى ازداد كثيرا نتيجة زيادة عدد الاصابات.
اكبر عامل مهيئ للطفرات هو ترك الفيروس ينتشر بعدد كبير من الناس و بسهولة كبيرة هذا يعني اننا نترك الفيروس يتكاثر في اعداد بنسب وسرعات هائلة في البشر وبالتالي نسبة الاخطاء والطفرات تصبح اكبر بكثير وبالتالي يصبح احتمال حدوث ليس طفرات فقط بل سلاسل جديدة لديها قدرة فتك اكبر بكثير.
اما احتمال حدوث طفرات تقلل فوعة الفيروس وتقضي عليه فهذه حالة قليلة واردة ولكن تحدث غالبا في الفيروسات العدوانية وليس الفيروسات ضعيفة الضراوة مثل كو*ر*و*نا

بعض المصادر
Spampinato . Protecting DNA from errors and damage: an overview of DNA repair mechanisms in plants compared to animals. Cellular and Molecular Life Science. 2017;74(9):1693–709.
Smith EC, Denison MR. Coronaviruses as DNA wannabes: A new model for the regulation of RNA irus replication fidelity PLoS Pathog. 2013;9(12):e1003760. pmid:24348241
Couce A, Viraphong Caudwell L, Feinauer C, Hindré T, Feugeas J-P, Weigt M, et al. Mutator genomes decay, despite sustained fitness gains, in a long-term experiment with bacteria. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017;114(43):e9026–e35. pmid:29073099
SARS-CoV-2 Spike Variant D614G Favors an Open Conformational State View ORCID ProfileRachael A. Mansbach, View ORCID ProfileSrirupa Chakraborty, View ORCID ProfileKien Nguyen, View ORCID ProfileDavid C. Montefiori, View ORCID ProfileBette Korber, View ORCID ProfileS. Gnanakarandoi: https://doi.org/10.1101/2020.07.26.219741
Spike mutation pipeline reveals the emergence of a more transmissible form of SARS-CoV-2 View ORCID ProfileB Korber, View ORCID ProfileWM Fischer, View ORCID ProfileS Gnanakaran, H Yoon, View ORCID ProfileJ Theiler, W Abfalterer, View ORCID ProfileB Foley, EE Giorgi, View ORCID ProfileT Bhattacharya, MD Parker, DG Partridge, CM Evans, TM Freeman, View ORCID ProfileTI de Silva, on behalf of the Sheffield COVID-19 Genomics Group, View ORCID ProfileCC LaBranche, View ORCID ProfileDC Montefioridoi: https://doi.org/10.1101/2020.04.29.069054
MEGA7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets‏S Kumar, G Stecher, K Tamura - Molecular biology and evolution, 2016‏ - academic.oup.com
The D614G mutation in the SARS-CoV-2 spike protein reduces S1 shedding and increases infectivityLizhou Zhang, Cody B Jackson, Huihui Mou, Amrita Ojha, Erumbi S Rangarajan, Tina Izard, Michael Farzan, Hyeryun Choedoi: https://doi.org/10.1101/2020.06.12.148726Now published in Nature Communications doi: 10.1038/s41467-020-19808-4
Mansbach, R. A. et al. Preprint at bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.07.26.219741 (2020).
Weisblum, Y. et al. Preprint at bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.07.21.214759 (2020).
Starr, T. N. et al. Cell 182, 1295–1310 (2020).
Weissmann, D. et al. Preprint at bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.07.22.20159905 (2020).